多年后，漩涡鸣人等人相继结婚有了孩子，《博人传》以漩涡鸣人的儿子漩涡博人为主角展开的剧情。即便如此，在《火影忍者》中依然存留着一些未解之谜。
千手柱间是湿骨林仙术？
火影忍者中有三大仙术，分别是妙木山仙术、龙地洞仙术和湿骨林仙术，掌握妙木山仙术的忍者有自来也、漩涡鸣人等人，掌握龙地洞仙术的忍者有药师兜等人，而湿骨林仙术在剧情中始终没有揭晓，根据大蛇丸对应龙地洞仙术，自来也对应妙木山仙术，纲手应该对应的是湿骨林仙术。
初代火影千手柱间是忍者世界的强者，除了擅长使用木遁术以外，常用的能力还有仙术，只是千手柱间施展的是何等仙术一直未公布，然而纲手是千手柱间的孙女，导致不少人猜测千手柱间施展的仙术便是来自湿骨林仙术，不过直到第四次忍者大战结束后还是一个谜。
大筒木辉夜怀孕？
在原作者岸本齐史的《火影忍者》漫画中提到，大筒木辉夜怀上两个儿子是获得了“大家的祝福”，这样的说辞太含糊，基本上没人看得懂。而《火影忍者》动画中不能说的这么玄乎，把设定改了一下，提到大筒木辉夜和祖之国的首领结合生下的孩子，让这件事变得符合情理了，如果根据原作的说法，是一个未解之谜。
自来也死没死？
自来也和佩恩六道一战后牺牲了，让不少火影迷无法接受，在第四次忍界大战中，药师兜通灵出很多已故的强者，却没有自来也。药师兜提到自来也的尸体没有找到，沉入了大海。显然这样的说法不能服众。
没料到的是，《博人传》中刚出现了一个叫做果心居士的人，戴着面具，果心居士身上的设定与自来也非常的相似，导致火影迷深信自来也还活着，让果心居士就是自来也的相关话题热度非常高，比前两个高出很多，位居榜首，可惜的是目前果心居士的身份未公开。
以上便是本次提到的几个未解之谜，至于白是男是女？旗木卡卡西的真容？等等之前的迷早就已经不是什么秘密，就不再说明了。你们觉得《火影忍者》中还有哪些未解之谜呢？
